Hanaholmen har en lång tradition som forum för större och mindre konferenser inom vetenskap och högre utbildning. Inom dessa områden finns många ämnen som lämpar sig för att dryftas bilateralt på axeln Sverige-Finland, eller nordiskt. En sådan jämförelse mellan våra länder är något som lätt undanskyms i det nationella beslutsfattandet, också inom vetenskap och kultur.

Ända från kulturcentrets första år har särskilt språk och historia varit återkommande ämnen inom Hanaholmens egen programverksamhet, ofta tillsammans med olika vetenskapliga samfund. Målsättningen har varit att fördjupa frågeställningarna i de ämnen som behandlas och nå resultat som kan tillämpas i båda länderna.

Hanaholmen satsar i sin verksamhet speciellt kraftigt på att främja samarbete inom området högre utbildning och forskning för att stödja det mycket aktiva utvecklingsarbetet som pågår inom bägge ländernas universitets- och högskolesektorer.