Hanaholmen erbjuder många olika typer av verksamhet kring utbildnings- och forskningsområdet, bland annat:

• program för barn och unga i grundskolor och gymnasier i hela landet (Svenska nu)
• språk- och kulturkurser (finska och andra nordiska språk)
• fortbildningskurser för lärare (skolvärlden)
  
• olika typer av akademiska seminarier, konferenser och projekt (högre utbildning och forskning)
  

Hanaholmen satsar 2009 och 2010 speciellt kraftigt på att främja samarbete inom området högre utbildning och forskning för att stödja det mycket aktiva utvecklingsarbetet som pågår inom bägge ländernas universitets- och högskolesektorer. Ett annat viktigt område är lärarfortbildningen, där Hanaholmen tillsammans med Kulturfonden för Sverige och Finland piloterat nya utbildningskoncept.